Dua tahun setelah peristiwa Perang Ninja Besar Keempat, bulan yang Hagoromo Otsutsuki ciptakan sejak lama untuk menyegel Patung Gedo mulai turun ke dunia, mengancam untuk menjadi meteor yang akan menghancurkan segala sesuatu yang terkena dampak. Di tengah krisis ini, keturunan langsung Kaguya Otsutsuki bernama Toneri Otsutsuki mencoba untuk menculik Hinata Hyuga tetapi akhirnya menculik adik perempuannya Hanabi. Naruto dan sekutunya sekarang melakukan misi penyelamatan sebelum menemukan diri mereka terlibat dalam pertempuran terakhir untuk menentukan nasib segalanya.