Sekelompok prajurit ninja, yang dipimpin oleh seorang Ninja Iga bernama Yamata, menyaksikan bola api raksasa jatuh dari langit dan menabrak hutan. Ketika para pejuang menemukan dan berusaha mengidentifikasi objek, mereka menemukan alien yang menyerang dan berpesta pora dengan mereka. Yamata dan yang selamat bersumpah membalas dendam, tetapi dalam menantang alien, mereka belajar bahwa senjata mereka tidak memiliki efek.